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존 스튜어트 밀은 "자유론"이라는 고전에서 다음과 같이 자유를 기술하였다.틀렸다거나 해롭다는 이유로 의견의 표명을 가로막으면 안 되며, 표현의 자유를 일부만 제한하게 되면 곧 모든 표현의 자유가 제한되고 만다. 그러므로, 표현의 자유가 무제한 허용되어야 사회는 진보할 수 있다. 단, 이런 자유에 의해 다른 사람에게 직접 피해를 주면 안 된다그의 이와 같은 자유의 원칙에 대한 주장은 오늘날 전 세계의 민주주의 국가들의 가장 기본적인 정치원리로 받아들여지고 있으며, 표현의 자유는 시민의 기본권으로서 포괄적으로 인정되고 있다. 이런 자유론의 기본적인 원칙들은 크게 바뀌지 않겠지만, 클라우드로 대별되는 최근의 디지털 환경의 변화는 자유에 대한 의미에 대해 조금은 다르게 생각할 여지를 만들고 있다. 웹 2.0으로 대
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정지훈
2011.11.22 23:22
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데이터도 얻었고 public domain에 등록도 해보았다. 그렇다면 이제부터 내 Genome을 내스스로 한번 분석해 보도록하자. 하지만 이미 많은 연구자들이 personal genome 데이터를 해석해주는 다양한 툴들을 만들어 놓았으니 우선 이것들을 활용해서 분석하는 것 부터 시작해보도록 하자.InterpretomeInterpretome은 웹기반의 툴로서 스탠포드 대학의 유전학 강의를 듣는 학생들이 만든 것이다. Genome 데이터로부터 할 수 있는 다양한 분석을 웹상에 구현해 놓았으니 당신은 클릭만 하면 된다. 자신의 23andMe 포맷의 데이터를 업로드하면 서버상에서 분석해서 그 결과를 보여준다.Interpretome을 사용하기 위해서는 우선 23andMe 파일을 선택한 후 자신의 인종을 선택하는 작업
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hongiiv
2011.11.07 22:20
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자신의 genotype 데이터가 준비되었고, 또한 DTC 회사에서 제공하는 정보외에 다양한 정보를 얻기를 원할 것이다. 이러한 정보들을 얻기 이전에 과학계의 발전을 위해서 내 데이터가 쓰여지길 원하고 더불어 몇몇 유용한 정보를 더 얻기를 원한다면 다음의 서비스들은 당신에게 커다란 보람을 줄것이다.openSNPopenSNP은 최근에 만들어진 사이트로 자신의 결과를 다른사람들과 공유할 수 있도록 만들어진 웹 기반 시스템이다. 23andMe나 deCOMEme 사용들은 자신의 raw data를 업로드하고 다양한 방법으로 확인할 수 있다.Phenotypes머리카락색, 눈색 등의 이미 다른 사용자가 만들어진 phenotype 정보에 자신의 phenotype을 적거나, 없는 phenotype의 경우 자신이 직접 질문을
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hongiiv
2011.11.07 22:19
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Day3에 이어서 Interpretome을 이용하여 자신의 genome을 분석하는 시간이다. 이번에는 Clinical과 Ancestry 기능으로 우선 Ancestry 기능을 위주로 살펴보도록 하겠다.관련글:1,000개의 SNP를 가지고 비교한 결과 난 87.738%로 Stuart와 제일 유사PCA유사성이 개인 간에 같은 genome 정보를 얼마나 공유하는지를 보는 것이었다면, PCA는 각 인종을 대표하는 Reference Panel을 X,Y의 2차원적인 그래프에 표시하는 방법이다. 여기에서도 IBS 값을 사용하며, 각 사람의 IBS 값을 대표하는 값을 추출하게 된다. 이렇게 다양한 차원의 값(IBS)을 차원축소를 수행하는데, 대표적인 방법이 PCA라는 방법이다. 즉 (1,2,2,3........3) -> (
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hongiiv
2011.11.06 22:52
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Genotyping 데이터나 Sequencing 데이터의 가격이 점차 하락과 함께 23andMe나 deCODEme와 같은 DTC(소비자직접거래) 방식의 Personal genome 서비스를 통해 자신의 질병에 대한 유전적인 소인이나 자신의 조상에 대한 정보를 얻을 수 있게 되었다. 23andMe 서비스를 받았다면, 자신의 Genotype 데이터를 따로 받을 수 있다. 23andMe에 로그인한 후 Download raw data를 선택하면 자신의 genotype raw 데이터를 다운로드가 가능하다.SNPTips를 사용하면 firefox web browser를 pop-up 창에서 SNP 정보를 확인할 수 있게 된다. 23andMe에서도 이와 비슷하게 SNP 정보를 확인 할 수 있다. 23andMe의 경우 SNP
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hongiiv
2011.11.02 22:04
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메디컬 앱 소개 여덟 번째 시간입니다.오늘 소개할 앱은 Clinical Care Options(CCO)이라는 회사에서 만든 앱입니다.현재 Oncology와 HIV에 대해서만 앱이 출시되었는데요. 그 중 Oncology를 소개합니다."Oncology inPractice"라는 이름을 가진 이 앱은Breast / GI /GU / Lung / H&N / Gyn / Skin / Sarcomas/ Brain&CNS / Hemato 에 이르는 모든 암종에 대해서병리기전 / 진단 / 검사 / 치료 / 추적관찰 / 예후 등에 대한 내용을 방대하게 담고 있습니다.(아이패드 버전은 1Gbytes가 넘고요. 아이폰 버전은 170Mbytes 정도 됩니다.)앱 스토어에 등록된 소개에 따르면,수록된 내용이 최신 내용으로 수시로 업데이
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cataka
2011.10.28 00:38
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필리핀 슬럼가에는 집안에 햇빛이 들지 않아서 대낮에도 어두운 집이 많다. 그렇지만, 이런 가난한 집안에서 전기를 끌어다 쓴다는 것은 커다란 사치이다. 이런 슬럼가에 한 줄기 빛을 전기도 없이 밝힐 수 있는 혁신적인 프로젝트가 소개되어 화제다. 흔히 구할 수 있는 플라스틱병에 물과 표백제를 약간 넣고, 지붕에 작은 구멍을 뚫어서 꽂으면 햇빛을 산란시켜서 집안 전체를 마치 형광등을 켠 것처럼 밝혀주게 된다. 55~60와트 백열등에 해당하는 밝기의 빛을 1년에 10개월 가까이 공급할 수 있다. 이 프로젝트는 Illac Diaz 라는 생태 운동가에 의해 진행이 되었다. 이 기술의 최초 아이디어는 MIT의 학생에 의해서 제시되었다고 한다. 이렇게 제작된 물병등(?)은 5년 정도는 지속되는데, 첨가된 표백제가 이끼 등
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정지훈
2011.10.26 00:01
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메디컬 앱 소개 일곱 번째 시간입니다.앞서 의학에 사용되는 모든 공식을 모아 두고 계산할 수 있는 MedCalc라는 앱(세 가지 기능이 차례로 나열되어 있는데요. 첫 번째가 검사 값을 확인할 수 있는 메뉴, 두 번째가 약자를 검색할 수 있는 메뉴 그리고 세 번째가 접두/접미어의 뜻을 찾을 수 있는 메뉴입니다. 설정에서는 처음 앱을 실행했을 때 뜨는 메뉴를 지정할 수 있어요.총 256개의 자주 사용하는 검사 값이 계통 별로 깔끔하게 정리되어 있습니다. 아래 메뉴 바에 있는 "View All Labs"를 누르면 알파벳 순으로 정리된 것도 볼 수 있습니다.하나를 선택해서 자세히 살펴볼까요?Acid/Base Balance의 "Anion Gap"을 선택했습니다.가장 위에 정상값이 SI와 US 단위계로 표시되어 있고요
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cataka
2011.10.26 00:01
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