얼마 전
Dodecad Ancestry Project 블로그
Pontikos는 2,200명 이상의 사람들로부터 몇십만개에 달하는 인간의 유전변이 (SNP, Single-letter DNA variation)를 분석했다. 이는 공개되어 사용 가능한 데이터와 함께 그의 블로그 독자 중 23andMe와 같은 유전자검사 업체를 통해 얻어진 정보를 가진 200여명의 사람들의 자발적으로 제공된 데이터가 포함되어 있다. 블로그 구독자들은 그들의 자신의 조상에 대한 정보를 열망하고 있다. 하지만 그리스인인 Pontikos는 이러한 부분보다는 population history 부분에 더욱 관심을 가지고 있다고 한다.
Dodecad Ancestry Project를 통해 분석된 조상 정보
David Wesolowski는 31살의 호주인으로 Eurogenes ancestory 프로젝트 (http://bga101.blogspot.com)를 통해 population에 대한 이해에 관심을 가지고 있다. 그와 그의 동료들은 아리아인의 후손인 이란과 동부 터키인들의 population history에 관심을 가지고 있으며 그들이 보내온 DNA를 가지고 예비 조사를 한 결과 이들이 유대인과 한번 섞인것을 확인 할 수 있으며, 이는 피어-리뷰 논문에 그 결과를 제출했다.
Eurogenes ancestry Project 블로그
아직까지는 개인의 조상에 대한 정보 보다는 더 큰 인구집단을 대상으로
Pickrell은 Dodecad나 Eurogenes가 자신들의 유전연구나 인구집단의 역사를 분석하기 위해 최신의 오픈소스 기반의 소프트웨어와 기술을 사용하고 있다고 언급하고 있다. 이러한 방법 (과거 인구집단간 교류에 대한 모델링, 많은 양의 지놈에서 정보를 뽑아내는 등의)은 분명하게 표현하는 데에 어려움이 있으며, 피어-리뷰 논문에서 논쟁거리 중의 하나라고 John Novembre (캘리포니아 대학의 population geneticist)는 말하고 있다. 유대 혈통의 Behar는 두 프로젝트에서 자신의 지놈 데이터를 제공하고 있으며, 그는 현재의 기술은 개인의 조상에 대한 것보다는 해당 민족 (인종)의 역사에 적용할 것을 이야기 하고 있다.
지놈 정보의 공개에 대한 우려
이렇게 개인의 지놈 정보를 제공하는 것에 대해서 그리 염려할 것은 아니라고 스탠포드 대학의 Center for Law and Biosciences의 소장은 말하고 있다. 이 두 프로젝트는 충분히 개인정보에 대한 보호를 제공하고 있다고 말하고 있다. 이렇게 사람들은 그들의 지놈을 통해 그들의 선조에 대한 대해 알아보는것에 대해 충분히 흥미를 가질 수 있지만, 바이오 메디컬에 적용하기 위해서는 유전과 형질에 대한 좀 더 많은 데이터를 필요로 하며 아마추어들에 의해 분석되기에는 분명 어려움이 따르며, 여기에는 좀 더 민감한 데이터로 조심스럽게 다뤄져야 한다. 미 NIH의 건강 데이터베이스인 Genotypes and Phenotypes과 같은 공공 저장소는 이러한 접근을 강력하게 제한하고 있다.
지놈의 일상화
하버드 메디컬 스쿨의 George Church는 이러한 변화에 대한 노력으로 이 프로젝트는 100,000명의 사람들의 지놈 시퀀싱과 형질정보에 대한 완전하고 누구나 자유로운 접근을 목표로 하고 있다. 현재 1,000명에 참가자와 10명에 대한 완전한 지놈정보를 제공하고 있다. Pickrell과 11명의 과학자와 지놈 전문가들은 Genomes Unzipped 프로젝트 (http://www.genomesunzipped.org/data)를 통해 그들이 지놈 데이터를 자유롭게 사용하도록 하고 있다. Church는 컴퓨터에 정통한 사람들이 페이스북과 같은 온라인 업체와 마찬가지로 바이오인포매틱스를 이용한 고품질의 지놈데이터를 제공함으로서, 이들이 유전체 분야에 큰 공헌을 할 것이라고 말하고 있다.
Genome Unzipped 블로그에 공개된 개인 지놈 정보
Personal Genome Project에 공개된 개인 정보
처음에는 블로그 구독자나 공개된 데이터를 가지고 조상에 대한 정보를 분석하고 그 결과를 블로그에 게재하고 있는 블로거들과 그들의 프로젝트에 대해서 이야기를 하고 있다가 이러한 데이터가 조상의 분석에 그치지 않고 사람들의 지놈과 형질(키, 몸무게, 병력 등등) 정보를 포함한 고품질의 데이터를 생산하고 공개하고 있는 George Church에 대해서 이야기 하면서 이러한 데이터가 향후 이러한 블로거들처럼 많은 컴퓨터 전문가에 의해 다루어지면서 유전체 분야가 발전할 것이라고 이야기 하고 있다.
hongiiv
hongiiv@gmail.com